| Дирекция ИОФ РАН | чл.-корр. РАН Гарнов Сергей Владимирович |
| Ученый Совет ИОФ РАН | чл.-корр. РАН Гарнов Сергей Владимирович |
| Научный руководитель ИОФ РАН | академик РАН Щербаков Иван Александрович |
| Диссертационные советы | |
| Отдел аспирантуры | Ракова Ирина Александровна |
| Научно-техническая библиотека | Максимкина Ольга Геннадьевна |
| Отдел международного сотрудничества | к.ф.-м.н., доцент Малахов Юрий Иванович |
| Единая служба главного инженера ИОФ РАН | Волгапкин Сергей Никитович |
| Научный центр волоконной оптики им. Е.М. Дианова РАН (НЦВО РАН) - обособленное подразделение ИОФ РАН | д.ф.-м.н. Семёнов Сергей Львович |
| Научный центр волновых исследований ИОФ РАН | к.ф.-м.н. Лямшев Михаил Леонидович |
| Научный центр лазерных материалов и технологий ИОФ РАН | д.ф.-м.н., профессорЦветков Владимир Борисович |
| Центр естественно-научных исследований ИОФ РАН | академик РАН Конов Виталий Иванович |
| Центр биофотоники | д.биол.н. Гудков Сергей Владимирович |
| Центр физического приборостроения ИОФ РАН (г. Троицк) | к.т.н. Коренский Михаил Юрьевич |
| Отдел взаимодействия когерентного излучения с веществом | к.ф.-м.н Кочиев Давид Георгиевич |
| Отдел колебаний | чл.-корр. РАН Гарнов Сергей Владимирович |
| Отдел мощных лазеров | д.ф.-м.н., профессор Аполлонов Виктор Викторович |
| Отдел низких температур и криогенной техники | д.ф.-м.н., доцент Глушков Владимир Витальевич |
| Отдел оптической спектроскопии | д.ф.-м.н., профессор Смирнов Валерий Васильевич |
| Отдел инфракрасной техники | к.ф.-м.н. Калинушкин Виктор Петрович |
| Отдел субмиллиметровой спектроскопии | д.ф.-м.н. Спектор Игорь Евсеевич |
| Отдел физики плазмы | к.т.н. Степахин Владимир Дмитриевич |
| Отдел фотоэлектроники | к.ф.-м.н. Воробьев Николай Сергеевич |
| Отдел молекулярной физики и диагностики | д.ф.-м.н., профессор Степанов Евгений Валерьевич |
| Теоретический отдел | д.ф.-м.н. Гусейн-заде Намик Гусейнага оглы |
| Научно-образовательный центр | Ракова Ирина Александровна |
| Тарусский филиал ИОФ РАН | |